Se per partizioni di base intendi che sono primarie, puoi fare boot da entrambe senza problemi. Se vuoi installare due sistemi operativi in contemporanea, basta che usi un boot loader adeguato. Win XP (come la famiglia NT) supporta il multiboot, idem per quanto riguarda linux. Spiega meglio cosa vuoi fare, cosi` potrai avere risposte piu` accurate.
Faccio un po' di storia dei fatti: ho installato un nuovo disco e creato due partizioni:C ed E. Sulla E ho installato W xp e sei programmi. Successivamente ho fatto il ghost del mio vecchio HD (che aveva W 98) e messo in C. A questo punto ho voluto aggiornare il '98 con l'xp. Ora il boot me lo fa da C e i famosi "sei programmi" di cui prima non mi partono più (in verità ne parte solo uno!). Ho postato il messaggio perchè penso che se riesco fare il boot da E riprenderanno ad avviarsi anche i programmi che avevo caricato... Sono consapevole che potrei rifare l'installazione in C, ma se potessi risparmiarla sarebbe meglio...grazie dell'aiuto!